More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2408 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
339 aa  689    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  89.38 
 
 
339 aa  629  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.92 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.85 
 
 
322 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.45 
 
 
316 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.04 
 
 
351 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.7 
 
 
351 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.02 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.94 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.2 
 
 
333 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.71 
 
 
354 aa  215  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.8 
 
 
322 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.63 
 
 
327 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  37.5 
 
 
380 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.82 
 
 
355 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  35.38 
 
 
325 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.3 
 
 
385 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.3 
 
 
385 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 
375 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 
325 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 
325 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 
325 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
325 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.29 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.69 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.24 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
354 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
325 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  33.63 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.83 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.66 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  36.89 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.95 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.76 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  34.8 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.53 
 
 
325 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.87 
 
 
356 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.69 
 
 
354 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.46 
 
 
354 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.04 
 
 
357 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.43 
 
 
372 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.18 
 
 
353 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.56 
 
 
354 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.91 
 
 
354 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 
325 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  36.75 
 
 
321 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  34.46 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.5 
 
 
323 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.75 
 
 
375 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.5 
 
 
323 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  34.08 
 
 
323 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.23 
 
 
325 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.79 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.15 
 
 
325 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  34.83 
 
 
384 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.75 
 
 
321 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.98 
 
 
353 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.75 
 
 
324 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
321 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.2 
 
 
322 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.91 
 
 
355 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.54 
 
 
374 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.66 
 
 
370 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.86 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  33.77 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.62 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  33.87 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.42 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.89 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  33.97 
 
 
323 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  32.76 
 
 
354 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.09 
 
 
337 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.55 
 
 
322 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  35.76 
 
 
337 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.13 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  32.76 
 
 
354 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.84 
 
 
363 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.52 
 
 
358 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  35.19 
 
 
333 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.33 
 
 
390 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.89 
 
 
360 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.23 
 
 
395 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.5 
 
 
324 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.92 
 
 
368 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.65 
 
 
381 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
383 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  30.97 
 
 
363 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  29.87 
 
 
363 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.19 
 
 
340 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.06 
 
 
353 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
314 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  31.85 
 
 
360 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  30.13 
 
 
372 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.52 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.35 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>