More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0708 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  96.15 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  78.08 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  75.69 
 
 		 263 aa  408  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  66.03 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 250 aa  317  7.999999999999999e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0986  FeS assembly ATPase SufC  62.75 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  62.31 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  61.92 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  61.92 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  60.94 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  61.81 
 
 		 259 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  61.66 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4168  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  59.77 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  59.77 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1974  ABC-type transport system for Fe-S cluster assembly, ATPase component  59.22 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  59.77 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  59.77 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  59.77 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  59.77 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  61.42 
 
 		 259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  59.38 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  59.38 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  59.77 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  59.53 
 
 		 247 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0474  FeS assembly ATPase SufC  60.16 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.754758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  58.98 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  61.18 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  56.2 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  59.76 
 
 		 249 aa  299  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  59.68 
 
 		 252 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 253 aa  297  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  59.04 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  57.94 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  57.47 
 
 		 261 aa  295  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  58.04 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  59.92 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  57.94 
 
 		 260 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  56.97 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  57.53 
 
 		 262 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0487  FeS assembly ATPase SufC  58.96 
 
 		 252 aa  291  6e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.364835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  56.86 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  56.86 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  57.54 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  57.65 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  59.38 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2038  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  58.27 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  57.71 
 
 		 254 aa  289  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  56.69 
 
 		 252 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  55.78 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  57.87 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  55.73 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  55.39 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  55.39 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  55.39 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1114  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, ATPase component  60.16 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.539485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  57.43 
 
 		 263 aa  284  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  58.2 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0891  FeS assembly ATPase SufC  57.31 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  57.25 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2915  FeS assembly ATPase SufC  56.86 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  60.32 
 
 		 248 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  56.5 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  55.51 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  55.42 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2067  FeS assembly ATPase SufC  56.35 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.962142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  57.31 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1984  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.2 
 
 		 253 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  56.64 
 
 		 261 aa  281  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  55.42 
 
 		 263 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  56 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  55.94 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  57.72 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  57.25 
 
 		 262 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  57.81 
 
 		 251 aa  281  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  58.75 
 
 		 252 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  58.17 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  53.54 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0604  Fe-S cluster assembly ABC transporter ATPase  57.71 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.164231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  56.63 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  57.31 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  57.71 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3675  FeS assembly ATPase SufC  54.96 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  56.91 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  56.13 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  57.71 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  57.09 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  56.32 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2445  FeS assembly ATPase SufC  56.69 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.0543991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1663  FeS assembly ATPase SufC  55.51 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  56.57 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>