31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0044 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  770    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  46.42 
 
 		 336 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  42.16 
 
 		 593 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  38.89 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  30.83 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  43.06 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  41.1 
 
 		 226 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 620 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 482 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  36 
 
 		 241 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  31.19 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  27.1 
 
 		 185 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  27.45 
 
 		 178 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  34.21 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  25.43 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0122  hypothetical protein  29.21 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.979419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  33.78 
 
 		 87 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 281 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  24.12 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>