22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2332 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  82.71 
 
 		 208 aa  330  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  83.64 
 
 		 213 aa  329  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  80.56 
 
 		 216 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  80.09 
 
 		 216 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  77.67 
 
 		 213 aa  314  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  70.42 
 
 		 211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  41.01 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  38.89 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  34.86 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  33.49 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  35.2 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  36.96 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  29.85 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  33.97 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  27.6 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  25.26 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  29.68 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  26.92 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  30.39 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  37.88 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>