243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1607 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  100 
 
 		 241 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  51.38 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  52.99 
 
 		 240 aa  204  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  52.99 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  52.99 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  50.64 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  52.99 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  52.99 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  52.99 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  52.99 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  52.31 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  51.6 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  53.7 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  50.21 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  51.39 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  51.85 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  50.93 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  50.93 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  48.62 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  47.22 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  47.22 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  47.22 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  47.22 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  46.76 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  46.4 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  45.75 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  45.45 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  44.5 
 
 		 228 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  45 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  45.79 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  44.55 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  46.89 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  40.49 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  42.22 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  42.79 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  44.76 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  43.11 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  39.24 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  40.09 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  43.93 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  36.94 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  39.92 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  42.5 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  38.29 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  39.5 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  39.5 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  42.52 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  42 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  42 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  38.21 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  45.29 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  39.71 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  39.71 
 
 		 239 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  39.71 
 
 		 239 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  39.71 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  37.04 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  37.74 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  37.74 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  38.03 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  43 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  37.26 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  37.74 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  37.26 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  37.26 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  37.26 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  37.26 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  36.79 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  33.63 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  42.65 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  42.65 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  30.33 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  33.18 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  34.29 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  31.25 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  33.18 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  33.18 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  33.18 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  31.25 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  33.18 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  31.92 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  35.55 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  39.49 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0903  LrgB family protein  41.12 
 
 		 229 aa  125  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000464548 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  35.19 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  33.5 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  37.17 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  33.18 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  33.18 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  33.18 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>