More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0528 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  82.21 
 
 		 304 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2537  transcription regulator transcription regulator protein  66.55 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2406  transcriptional regulator, LysR family  64.77 
 
 		 298 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2812  transcriptional regulator, LysR family  65.2 
 
 		 297 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  60.94 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 300 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 300 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  56.9 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 300 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  52.76 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  52.76 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  52.76 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  51.89 
 
 		 308 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  51.89 
 
 		 308 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  51.89 
 
 		 308 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  51.89 
 
 		 308 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  51.89 
 
 		 308 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  52.41 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  52.41 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  46.39 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2261  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  40.64 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.71 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4699  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254912  normal  0.0113206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5168  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4125  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0971923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2806  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4776  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3391  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.279491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3330  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.43 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>