More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1147 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
330 aa  685  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
321 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
318 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
334 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
318 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
544 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  48.46 
 
 
322 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
930 aa  120  4e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  43.9 
 
 
295 aa  118  1e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
294 aa  119  1e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
352 aa  118  2e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
294 aa  117  2e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
347 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
373 aa  117  4e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  43.18 
 
 
244 aa  115  7e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 
727 aa  115  8e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
306 aa  115  8e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
398 aa  115  9e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  53.7 
 
 
1169 aa  115  1e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
327 aa  115  1e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  41.41 
 
 
377 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
313 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
333 aa  113  4e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
1739 aa  113  4e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
1015 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
373 aa  112  8e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  43.07 
 
 
785 aa  112  8e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
344 aa  112  8e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  31.9 
 
 
299 aa  112  1e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  9.37683e-12 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.84 
 
 
350 aa  112  1e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
347 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
689 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
311 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
338 aa  110  4e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  31.37 
 
 
300 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  47.66 
 
 
340 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  43.33 
 
 
321 aa  109  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  40.88 
 
 
324 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  44.19 
 
 
347 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
351 aa  109  8e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
376 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 
351 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
573 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
330 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  40.15 
 
 
341 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
321 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
357 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  45.87 
 
 
326 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
303 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
305 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
1035 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  49.54 
 
 
616 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  43.41 
 
 
345 aa  106  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  29.43 
 
 
708 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
294 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
365 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
774 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
261 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
338 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  47.57 
 
 
326 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
305 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 
347 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
336 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  31.64 
 
 
338 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
326 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
380 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
324 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
321 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
353 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
898 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  39.02 
 
 
287 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  40.31 
 
 
316 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  47.57 
 
 
326 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  46.03 
 
 
379 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 
351 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.43 
 
 
466 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
898 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
300 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  31.27 
 
 
296 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
361 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
326 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
390 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
325 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
363 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
277 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  5.84386e-06 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
349 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
280 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  45.37 
 
 
1157 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  38.06 
 
 
321 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
336 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
397 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.4 
 
 
255 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.31 
 
 
326 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
287 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  47.93 
 
 
704 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
303 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 
280 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
295 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  46.46 
 
 
773 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
337 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>