121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0056 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
151 aa  306  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  92.05 
 
 
151 aa  288  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.33 
 
 
152 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.48 
 
 
156 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.82 
 
 
157 aa  162  2e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  51.75 
 
 
150 aa  160  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  51.75 
 
 
150 aa  159  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.55 
 
 
152 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.35 
 
 
213 aa  157  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  49.31 
 
 
148 aa  156  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
154 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.22 
 
 
148 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.89 
 
 
216 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.83 
 
 
151 aa  146  1e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.52 
 
 
153 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.14 
 
 
148 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.52 
 
 
155 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.77 
 
 
158 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.08 
 
 
154 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.82 
 
 
158 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.82 
 
 
158 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.83 
 
 
147 aa  138  2e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.45 
 
 
154 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.19 
 
 
182 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.44 
 
 
187 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.48 
 
 
155 aa  126  1e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.58 
 
 
202 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.06 
 
 
178 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.06 
 
 
176 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  39.19 
 
 
161 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.43 
 
 
197 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  43.06 
 
 
176 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40 
 
 
198 aa  119  1e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  39.86 
 
 
232 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40 
 
 
193 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.07 
 
 
246 aa  115  1e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.34 
 
 
204 aa  115  1e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.73 
 
 
243 aa  115  2e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  37.59 
 
 
213 aa  114  4e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.68 
 
 
151 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 
224 aa  113  8e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 
224 aa  113  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.73 
 
 
269 aa  109  1e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.46 
 
 
208 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.67 
 
 
152 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.61 
 
 
241 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.61 
 
 
249 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  41.67 
 
 
176 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.72 
 
 
181 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.1 
 
 
222 aa  76.3  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.33 
 
 
983 aa  76.3  1e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.5 
 
 
223 aa  76.3  1e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  32.61 
 
 
221 aa  72.4  2e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  28.26 
 
 
997 aa  72  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.53 
 
 
154 aa  71.2  4e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 
153 aa  71.2  5e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.81 
 
 
987 aa  69.7  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.74 
 
 
141 aa  70.1  1e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.6 
 
 
1012 aa  68.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.81 
 
 
229 aa  67.8  5e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.23 
 
 
1011 aa  67.4  6e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.23 
 
 
1011 aa  67.4  6e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.07 
 
 
220 aa  66.6  1e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.66 
 
 
208 aa  66.2  1e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.32 
 
 
1012 aa  64.7  4e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.21 
 
 
204 aa  64.3  5e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.06 
 
 
185 aa  63.9  6e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 
248 aa  63.5  9e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.65 
 
 
1019 aa  63.2  1e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.68 
 
 
980 aa  63.2  1e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  29.1 
 
 
991 aa  63.2  1e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.15 
 
 
988 aa  61.6  3e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.56 
 
 
206 aa  61.2  5e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.6 
 
 
988 aa  61.2  5e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.92 
 
 
216 aa  58.2  4e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2028  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.1 
 
 
56 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.08 
 
 
254 aa  57.4  7e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.61 
 
 
253 aa  56.2  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 
149 aa  56.6  1e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
225 aa  55.8  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.77 
 
 
306 aa  55.5  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  28.66 
 
 
253 aa  55.1  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  27.14 
 
 
1027 aa  54.7  4e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.87 
 
 
147 aa  54.3  6e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.08 
 
 
232 aa  54.3  6e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  29.45 
 
 
242 aa  53.9  7e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  29.45 
 
 
242 aa  53.9  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  29.45 
 
 
242 aa  53.9  7e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  29.45 
 
 
242 aa  53.9  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  29.45 
 
 
242 aa  53.9  7e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  29.45 
 
 
242 aa  53.9  7e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  29.45 
 
 
242 aa  52  3e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
241 aa  52  3e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.09 
 
 
241 aa  50.4  9e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.77 
 
 
237 aa  50.1  1e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.3 
 
 
244 aa  50.1  1e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.3 
 
 
150 aa  50.1  1e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
208 aa  49.7  1e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
251 aa  50.1  1e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>