79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3732 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  59.78 
 
 		 271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  69.64 
 
 		 224 aa  324  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  68.47 
 
 		 222 aa  323  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  64.13 
 
 		 223 aa  292  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  64.13 
 
 		 223 aa  292  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  62.95 
 
 		 224 aa  281  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  62.56 
 
 		 227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  61.61 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  45.29 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.91 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  44.84 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  44.84 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  42.49 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  41.36 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  39.48 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  39.48 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  35.32 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  34.89 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  29.79 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  31.56 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  31.78 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  29.82 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  33.8 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  25.42 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0757  phosphoglycerate mutase 1 family protein  30 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.276642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.2 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.18 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  38.46 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.35 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.11 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  31.94 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  35.21 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  27.36 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 215 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.29 
 
 		 369 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>