20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5656 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  69.58 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  71.29 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  71.29 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  62.38 
 
 		 456 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  34.52 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  36.34 
 
 		 414 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  33.08 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  36.5 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  37.12 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  34.28 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  23.24 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1861  efflux family outer membrane protein  23 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4441  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1600  OMF family outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 514 aa  46.6  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00101188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.94 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0759  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 534 aa  43.5  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000466855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>