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for query gene Reut_B4396 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
207 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.7 
 
 
491 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  60.11 
 
 
214 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  61.62 
 
 
223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  61.62 
 
 
223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  61.08 
 
 
223 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.29 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  59.04 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.44 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  57.53 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.23 
 
 
490 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  56.99 
 
 
218 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  56.99 
 
 
218 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.89 
 
 
219 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.3 
 
 
260 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.5 
 
 
225 aa  184  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.66 
 
 
224 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.2 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  50.26 
 
 
496 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.44 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.46 
 
 
495 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.27 
 
 
217 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.62 
 
 
230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.62 
 
 
230 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.63 
 
 
476 aa  174  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.35 
 
 
480 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.92 
 
 
209 aa  174  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.91 
 
 
546 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  48.73 
 
 
477 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.73 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.54 
 
 
213 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.02 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  48.45 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.3 
 
 
224 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.63 
 
 
206 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.06 
 
 
208 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.15 
 
 
202 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.78 
 
 
237 aa  168  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.99 
 
 
207 aa  167  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  46.77 
 
 
492 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  48.19 
 
 
474 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.66 
 
 
485 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.48 
 
 
485 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.73 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.83 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.9 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.59 
 
 
223 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.97 
 
 
484 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.72 
 
 
484 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.91 
 
 
216 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.55 
 
 
465 aa  158  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.56 
 
 
428 aa  158  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.11 
 
 
213 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.53 
 
 
485 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.53 
 
 
485 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.27 
 
 
485 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  46.77 
 
 
211 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.59 
 
 
229 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.16 
 
 
476 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.03 
 
 
479 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  47.46 
 
 
507 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.37 
 
 
493 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.87 
 
 
493 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.35 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.91 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.91 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.93 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.57 
 
 
201 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.26 
 
 
304 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.7 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.4 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.43 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.78 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.37 
 
 
210 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.21 
 
 
297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.55 
 
 
200 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
242 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.65 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.93 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.01 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  37.27 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  39.63 
 
 
210 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.26 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.56 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
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NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  37.5 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.71 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.14 
 
 
249 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.38 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
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NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.52 
 
 
219 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.96 
 
 
185 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.73 
 
 
264 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.27 
 
 
206 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.65 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.22 
 
 
194 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.08 
 
 
205 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
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NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.36 
 
 
249 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.84 
 
 
255 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
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NC_008819  NATL1_07331  Uracil-DNA glycosylase  36.99 
 
 
187 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.444861  hitchhiker  0.00512235 
 
 
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NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.78 
 
 
260 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.76 
 
 
300 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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