More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4003 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  100 
 
 		 271 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  75.37 
 
 		 307 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  53.9 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  53.31 
 
 		 306 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  53.36 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  52.03 
 
 		 303 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  52.03 
 
 		 272 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  50.55 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  52.27 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  53.36 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  49.24 
 
 		 308 aa  275  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  48.89 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  50.56 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  46.84 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  46.49 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  49.07 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  50 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  46.64 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  47.35 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  46.27 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  48.87 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  46.62 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  45.15 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  46.01 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  45.49 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  50.41 
 
 		 323 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  43.56 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  44.98 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  39.11 
 
 		 345 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  40.81 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  40.07 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  36.23 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.93 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.6 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.6 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.6 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.6 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  32.42 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  34.86 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  34.83 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  31.92 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  29.96 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  33.95 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  34.43 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  28.9 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  31.6 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  28.73 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  31.82 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  33.72 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  30.82 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  32.37 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  28.74 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.12 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  33.9 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  30.49 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  30.49 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.49 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  30.49 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  30.49 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  26.44 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  29.56 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.08 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  27.92 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  31.84 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  29.2 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  29.66 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  29.2 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  29.2 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  28.8 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  29.08 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  26.8 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  25.59 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  32.16 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.67 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  26.38 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  26.58 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2442  aldo/keto reductase  32.37 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  29.73 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1775  aldo/keto reductase  37.04 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360255  normal  0.42247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  29.77 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  30.04 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  29.41 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  26.17 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  32.64 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  27.21 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  30.04 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  34.13 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  28.09 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  30.24 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  25 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.95 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  35.88 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  26.82 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  34.05 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  30.12 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  32.99 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>