More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2007 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  100 
 
 
277 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  95.67 
 
 
277 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  84.84 
 
 
277 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  78.7 
 
 
277 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  70.04 
 
 
280 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  57.76 
 
 
277 aa  338  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.04 
 
 
281 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  57.4 
 
 
281 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  57.66 
 
 
281 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  55.96 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4255  aldo/keto reductase  59.42 
 
 
278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  55.11 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  56.93 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2530  aldo/keto reductase  56.57 
 
 
282 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  56.57 
 
 
281 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  55.6 
 
 
282 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  56.2 
 
 
281 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  56.2 
 
 
281 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  56.2 
 
 
281 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  57.04 
 
 
281 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
281 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  57.09 
 
 
282 aa  315  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.26 
 
 
282 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.26 
 
 
282 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.26 
 
 
282 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.26 
 
 
282 aa  314  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.9 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
281 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  57.55 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  54.15 
 
 
281 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.87 
 
 
281 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  52.31 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.43 
 
 
281 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.43 
 
 
281 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.43 
 
 
286 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.07 
 
 
286 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.07 
 
 
286 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.07 
 
 
281 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  55.19 
 
 
270 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
283 aa  292  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.11 
 
 
284 aa  291  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2596  aldo/keto reductase  53.6 
 
 
273 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
283 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
283 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.75 
 
 
284 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  48.75 
 
 
284 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  48.75 
 
 
284 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  48.75 
 
 
284 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  52.16 
 
 
273 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  48.75 
 
 
284 aa  289  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
284 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  54.07 
 
 
273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.75 
 
 
284 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.75 
 
 
284 aa  288  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53850  oxidoreductase  54.28 
 
 
273 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1775  aldo/keto reductase  53.16 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360255  normal  0.42247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  52.22 
 
 
273 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.69 
 
 
284 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  48.9 
 
 
294 aa  279  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  51.04 
 
 
296 aa  279  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  55.12 
 
 
284 aa  275  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3120  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.09 
 
 
253 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00828042  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1256  aldo/keto reductase  55.93 
 
 
273 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3700  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.37 
 
 
273 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1860  aldo/keto reductase  47.25 
 
 
279 aa  262  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000397966  hitchhiker  0.000000000147499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1775  aldo/keto reductase  50.37 
 
 
273 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.316569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3502  aldo/keto reductase  54.15 
 
 
276 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0118394  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2893  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
289 aa  241  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  49.82 
 
 
279 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3345  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
300 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
284 aa  234  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3942  aldo/keto reductase  50.35 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0842861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  48.41 
 
 
279 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  46.36 
 
 
275 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  39.93 
 
 
282 aa  225  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  48.92 
 
 
288 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2211  aldo/keto reductase  49.45 
 
 
281 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684458  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3254  aldo/keto reductase  48.73 
 
 
281 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  47.97 
 
 
279 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2442  aldo/keto reductase  48.18 
 
 
281 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  45.76 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  45.02 
 
 
279 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1578  aldo/keto reductase  38.55 
 
 
281 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0586561  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  38.35 
 
 
274 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  38.35 
 
 
274 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  36.26 
 
 
280 aa  168  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0944  aldo/keto reductase  39.52 
 
 
281 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1557  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
270 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1806  aldo/keto reductase  39.42 
 
 
272 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.155578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  37.34 
 
 
330 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  37.01 
 
 
330 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0946  aldo/keto reductase  32.69 
 
 
265 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.837346  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1630  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
270 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  35.28 
 
 
331 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  38.36 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  36.51 
 
 
326 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  32.97 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  38.17 
 
 
331 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  34.94 
 
 
274 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0452  aldo/keto reductase  34.75 
 
 
265 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>