More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3030 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  57.36 
 
 
643 aa  774    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  56.43 
 
 
643 aa  740    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  85.71 
 
 
644 aa  1141    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
644 aa  1308    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  55.66 
 
 
644 aa  786    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  61.43 
 
 
629 aa  768    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  54.57 
 
 
644 aa  760    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  56.66 
 
 
643 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  54.73 
 
 
644 aa  761    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  56.37 
 
 
646 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0608  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  51.01 
 
 
645 aa  625  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1709  peptidase catalytic subunit  48.67 
 
 
636 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0459  prolyl oligopeptidase family protein  48.51 
 
 
636 aa  617  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  51.55 
 
 
642 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.57 
 
 
655 aa  567  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.52 
 
 
693 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46.42 
 
 
646 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.98 
 
 
662 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  43.19 
 
 
702 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  40.03 
 
 
665 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.87 
 
 
683 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  43.98 
 
 
661 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.06 
 
 
643 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.35 
 
 
668 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.95 
 
 
626 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.81 
 
 
682 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.81 
 
 
682 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.16 
 
 
676 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.5 
 
 
683 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.81 
 
 
682 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.85 
 
 
677 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.81 
 
 
682 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.2 
 
 
675 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.453566  normal  0.217574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.33 
 
 
677 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.58 
 
 
677 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.33 
 
 
677 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  37.75 
 
 
678 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1383  prolyl oligopeptidase family protein  39.12 
 
 
686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.24 
 
 
719 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19830  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  42.15 
 
 
641 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646279  hitchhiker  0.000217512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3161  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.23 
 
 
662 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3453  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.84 
 
 
640 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000252279  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.05 
 
 
652 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2275  putative peptidase  40.72 
 
 
635 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.573468  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.74 
 
 
607 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  39.2 
 
 
651 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0587  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.4 
 
 
623 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0408  putative peptidase  39.71 
 
 
639 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.62 
 
 
607 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.85 
 
 
607 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  36.58 
 
 
612 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00771  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.02 
 
 
645 aa  356  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.248963  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.07 
 
 
608 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.32 
 
 
574 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0508  hypothetical protein  37.2 
 
 
610 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01331  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.54 
 
 
644 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.180596  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1432  dienelactone hydrolase  32.54 
 
 
644 aa  324  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.839365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  36.48 
 
 
608 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.59 
 
 
663 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956088  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  35.47 
 
 
608 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.69 
 
 
652 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1960  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.05 
 
 
610 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.317631  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00811  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.27 
 
 
641 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00801  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.89 
 
 
641 aa  240  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00781  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.7 
 
 
642 aa  240  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0071  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.04 
 
 
641 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.36 
 
 
638 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.46 
 
 
615 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.91 
 
 
656 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.83 
 
 
653 aa  155  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  28.12 
 
 
640 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.69 
 
 
632 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.42 
 
 
626 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.29 
 
 
656 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.06 
 
 
638 aa  144  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  34.26 
 
 
655 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  25.74 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  29.13 
 
 
657 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.23 
 
 
678 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.03 
 
 
600 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.13 
 
 
641 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.97 
 
 
626 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.89 
 
 
644 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.11 
 
 
652 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.84 
 
 
660 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.83 
 
 
626 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.7 
 
 
644 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.24 
 
 
631 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.61 
 
 
649 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.71 
 
 
617 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.7 
 
 
655 aa  134  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.25 
 
 
645 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.39 
 
 
626 aa  133  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.39 
 
 
626 aa  133  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.65 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  30.6 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.17 
 
 
629 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  31.35 
 
 
694 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.8 
 
 
652 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  29.43 
 
 
642 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>