77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1554 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  100 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  28.85 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  33.01 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2996  hypothetical protein  35.78 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3816  hypothetical protein  33.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0769  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  28.97 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0716  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  35.19 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  25.23 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  30.21 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0809  S23 ribosomal protein  32.46 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  31.19 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  31.13 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  26.96 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  31.48 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  31.07 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  30.63 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  24.04 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2639  S23 ribosomal protein  31.78 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4127  hypothetical protein  33.02 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  26.61 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4754  S23 ribosomal protein  31.37 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  31.25 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  29.91 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  28.83 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  30.56 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  30.56 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  35.96 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  30.56 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  27.47 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  30.56 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  29.21 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  34.12 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0596  S23 ribosomal protein  32.71 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0419728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  34.88 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  27.5 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  28.44 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0033  hypothetical protein  32.91 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  34.94 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  28.97 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  31.13 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3192  hypothetical protein  32.08 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2821  hypothetical protein  31.07 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  29.52 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  21.15 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0610  S23 ribosomal protein  29.82 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28865e-18 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2018  S23 ribosomal protein  28.45 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.575414  normal  0.264087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1383  hypothetical protein  31.13 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2403  hypothetical protein  38.03 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.589367  hitchhiker  0.00347564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1316  hypothetical protein  31.13 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0254819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  26.36 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2542  hypothetical protein  32.08 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  29.52 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  26.44 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353039  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  34.65 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1160  S23 ribosomal protein  27.68 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0925  S23 ribosomal protein  28.45 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  34.65 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  28.44 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  27.36 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1652  hypothetical protein  30.19 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  30.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  33.66 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  27.54 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  30.19 
 
 		 125 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  25.47 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  24.8 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  31 
 
 		 122 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>