55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3817 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  79.4 
 
 		 234 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  66.67 
 
 		 234 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  55.84 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  51.74 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  44.64 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  44.64 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  49.19 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  43.44 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  41.26 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  42.08 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  41.07 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  39.37 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  42.06 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  42.06 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  43.58 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  44.91 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  41.63 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  39.91 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  40.69 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  37.61 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  36.12 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  39.35 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  35.62 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  43.4 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  40.09 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  35.19 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  42.94 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  35.78 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  36.32 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  39.41 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  37.8 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  37.18 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  36.19 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  37.89 
 
 		 267 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  37.73 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  36.95 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  39 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  34.58 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  41.89 
 
 		 158 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  36.48 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  35.96 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  41.01 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  34.48 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  34.48 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  34.08 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  38.2 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  38.2 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  38.2 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  35.89 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  38.2 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  38.2 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1252  protein of unknown function DUF1045  30.87 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429508  normal  0.6572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  21.19 
 
 		 673 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>