54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4081 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  79.4 
 
 		 234 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  67.53 
 
 		 234 aa  317  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  57.58 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  50.87 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  44.5 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  44.5 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  43.69 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  42.11 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  43.78 
 
 		 227 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  41.2 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  44.27 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  41.2 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  43.95 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  42.47 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  37.61 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  41.74 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  37.61 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  39.91 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  40.69 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  38.57 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  37.83 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  43.87 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  43.78 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  37.18 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  35.59 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  40.45 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  40.62 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  51.54 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  35 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  38.46 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  40.91 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  37.12 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  37.78 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  34.62 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  34.82 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  37.05 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  33.04 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  38.5 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  37.08 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  39.19 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  39.37 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  36.82 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  37.14 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  37.14 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  39.37 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  39.37 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  39.37 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  39.37 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  39.37 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  39.37 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  40.88 
 
 		 158 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  33.63 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1252  protein of unknown function DUF1045  30.71 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429508  normal  0.6572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>