54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3153 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  90.21 
 
 
235 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  57.45 
 
 
235 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  55.17 
 
 
271 aa  274  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  51.06 
 
 
243 aa  242  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  50.63 
 
 
243 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  50.63 
 
 
243 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  48.09 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  42.55 
 
 
235 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  43.61 
 
 
233 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  41.15 
 
 
231 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  40.97 
 
 
231 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  36.56 
 
 
230 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  36.56 
 
 
230 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  38.64 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  35.98 
 
 
227 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  35.62 
 
 
234 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  32.6 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  34.8 
 
 
239 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  39.01 
 
 
226 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  34.56 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  36.07 
 
 
251 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  35.59 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  34.07 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  36.11 
 
 
241 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  33.78 
 
 
231 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  34.25 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  31.7 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  34.09 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  32.77 
 
 
237 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  33.77 
 
 
228 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  36.57 
 
 
233 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  42.75 
 
 
158 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  34.11 
 
 
223 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  34.5 
 
 
227 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  36.36 
 
 
225 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  31.96 
 
 
240 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  34.09 
 
 
221 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  31 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  30.74 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  33.48 
 
 
229 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  31 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  28.96 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  28.51 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  28.83 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  28.07 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  28.07 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1252  protein of unknown function DUF1045  24.89 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429508  normal  0.6572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>