54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4488 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  56.9 
 
 		 235 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  55.17 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  56.03 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  46.35 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  45.34 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  45.34 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  46.7 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  42.29 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  39.82 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  39.82 
 
 		 231 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  38.79 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  35.9 
 
 		 251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  38.79 
 
 		 230 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  36.56 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  36.56 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  37.44 
 
 		 234 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  36.32 
 
 		 234 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  35.68 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  37.12 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  32.6 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  35.51 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  32.74 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  31.53 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  33.18 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  35.68 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  31.9 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  29.87 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  34.54 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  33.92 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  34.08 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  33.04 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  33.04 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  33.04 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  31.98 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  33.33 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  31.96 
 
 		 237 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  29.07 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  34.11 
 
 		 223 aa  86.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  37.66 
 
 		 158 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  35.24 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  28.19 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  30.87 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  30.57 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  30.43 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  30.43 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  30.43 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  30.43 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  30.43 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  29.69 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  28.7 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1252  protein of unknown function DUF1045  26.19 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429508  normal  0.6572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>