54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2956 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  507  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  53.65 
 
 
241 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  50 
 
 
237 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  46.88 
 
 
231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  39.91 
 
 
243 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  39.91 
 
 
243 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  44.59 
 
 
230 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  44.59 
 
 
230 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  45.45 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  37.78 
 
 
243 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  37.33 
 
 
233 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  41.99 
 
 
230 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  40.36 
 
 
235 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  42.31 
 
 
247 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  39.46 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  40.42 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  40.85 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  38.79 
 
 
235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  40.3 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  44.14 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  39.01 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  43.23 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  37.61 
 
 
227 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  38.03 
 
 
235 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  37.12 
 
 
251 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  33.04 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  38.82 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  34.76 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  42.13 
 
 
220 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  38.22 
 
 
234 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  32.14 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  41.18 
 
 
234 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  39.66 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  40.69 
 
 
265 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  33.64 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  40.52 
 
 
259 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  40.11 
 
 
234 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  32.62 
 
 
225 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  32.62 
 
 
225 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  39.39 
 
 
271 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  39.39 
 
 
271 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  39.39 
 
 
265 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  39.39 
 
 
271 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  39.39 
 
 
271 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  36.21 
 
 
221 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  34.29 
 
 
262 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  36.67 
 
 
223 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  33.33 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  45.41 
 
 
229 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  35.19 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  40.4 
 
 
158 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  35.32 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1252  protein of unknown function DUF1045  38.39 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429508  normal  0.6572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>