53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0506 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  90.46 
 
 		 262 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  45.68 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  45.04 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  36.97 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  36.97 
 
 		 243 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  40.17 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  39.74 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  34.87 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  37.39 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  38.2 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  39.64 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  36.82 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  34.57 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  37.77 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  37.61 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  35.81 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  34.73 
 
 		 235 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  34.87 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  43.65 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  38.43 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  39.29 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  39.29 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  37 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  38.78 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  39.77 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  34.29 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  39 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  37.1 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  34.36 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  34.3 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  36.82 
 
 		 234 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  31.6 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  36.82 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  32.23 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  33.78 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  30.74 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  33.77 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  42.48 
 
 		 158 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  34.03 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  34.78 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  35.78 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  35.4 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  29.69 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  30.17 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  30.17 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  30.7 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  35.81 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>