28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1252 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1252  protein of unknown function DUF1045  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429508  normal  0.6572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  34.65 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  34.93 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  34.93 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  26.87 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  29.74 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  27.43 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  27.43 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  26.99 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  33.82 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  29 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  37.84 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  24.89 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  26.19 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  27.47 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  27.48 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  30.87 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  28.19 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  29.32 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  30.71 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  25.85 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  26.96 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  24.36 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  25.99 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  28.47 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  28.16 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  23.81 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  24.89 
 
 		 236 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>