55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4664 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  473  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  55.9 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  54.59 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  51.53 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  48.26 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  49.57 
 
 		 243 aa  223  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  49.57 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  50.85 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  44.68 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  42.55 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  46.93 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  40.43 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  43.89 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  38.79 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  41.81 
 
 		 251 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  45.66 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  43.56 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  43.56 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  41.07 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  41.59 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  42.47 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  40.53 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  42.73 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  40.61 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  35.78 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  37.73 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  39.45 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  38.77 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  35.19 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  38.79 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  40.35 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  39.57 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  37.66 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  33.64 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  36.73 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  36.56 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  37.78 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  34.73 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  32.03 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  32.03 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  37.78 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  34.73 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  38.77 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  37.33 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  37.33 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  37.33 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  37.33 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  37.33 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  40.27 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  33.91 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  35.87 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  39.1 
 
 		 158 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  20.69 
 
 		 673 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1252  protein of unknown function DUF1045  24.36 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429508  normal  0.6572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>