53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3356 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  60.85 
 
 		 235 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  57.45 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  56.03 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  47.66 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  49.34 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  49.34 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  44.26 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  40.43 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  40.71 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  39.82 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  40.09 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  35.98 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  35.98 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  36.92 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  37.85 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  37.18 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  35.81 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  44.57 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  35.78 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  35.68 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  35.41 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  35.1 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  37.33 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  34.8 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  37.85 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  35.14 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  35.68 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  32.46 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  32.46 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  34.2 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  36.67 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  37.08 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  35.96 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  33.93 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  31.65 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  33.02 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  38.64 
 
 		 158 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  37.7 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  32.75 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  34.36 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  33.03 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  31.78 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  32.75 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  32.75 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  32.75 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  32.75 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  32.75 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  27.8 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  30.7 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  34.8 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  27.93 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  29.31 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>