53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3358 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  98.87 
 
 
265 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  96.4 
 
 
259 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  94.92 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  94.92 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  94.92 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  94.92 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  61.9 
 
 
240 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  57.78 
 
 
247 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  58.67 
 
 
240 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  42.11 
 
 
237 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  41.52 
 
 
231 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  40.35 
 
 
233 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  38.16 
 
 
235 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  43.35 
 
 
239 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  37.39 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  36.1 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  37.39 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  36.1 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  43.23 
 
 
220 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  40.51 
 
 
255 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  43.72 
 
 
236 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  35.5 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  42.42 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  37.66 
 
 
267 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  39.73 
 
 
234 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  40.26 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  40.26 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  37.23 
 
 
234 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  39.22 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  38.03 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  40.3 
 
 
234 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  44.38 
 
 
227 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  37.83 
 
 
230 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  37.83 
 
 
230 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  43.86 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  35.52 
 
 
262 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  36.68 
 
 
262 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  37.45 
 
 
233 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  40.81 
 
 
226 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  37.22 
 
 
235 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  45.45 
 
 
229 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  41.41 
 
 
221 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  35.27 
 
 
234 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  42.08 
 
 
223 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  39.07 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  33.19 
 
 
271 aa  98.6  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  30.34 
 
 
235 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  34.75 
 
 
235 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  29.06 
 
 
235 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  37.55 
 
 
244 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  35.47 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  39.39 
 
 
158 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>