53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1036 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1036  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  421  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1754  hypothetical protein  44.78 
 
 
239 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.811997  normal  0.561171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0286  hypothetical protein  41.48 
 
 
233 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4427  phosphonate metabolism protein  42.36 
 
 
231 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4113  phosphonate metabolism protein  41.92 
 
 
231 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0825  protein of unknown function DUF1045  40.71 
 
 
234 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2367  hypothetical protein  36.8 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0859  hypothetical protein  37.39 
 
 
243 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0851  hypothetical protein  37.39 
 
 
243 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4664  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3551  hypothetical protein  40.34 
 
 
267 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3662  hypothetical protein  38.43 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.796567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4435  hypothetical protein  40.44 
 
 
251 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0771  phosphonate metabolism protein  42.37 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3817  hypothetical protein  42.94 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00248449  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5861  hypothetical protein  39.64 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.872024  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3696  hypothetical protein  41.85 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.470782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4081  hypothetical protein  51.54 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.231389  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0908  hypothetical protein  41.41 
 
 
230 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.484502  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2926  protein of unknown function DUF1045  43.82 
 
 
237 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3335  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2889  protein of unknown function DUF1045  34.78 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0822206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3864  phosphonate metabolism protein  48.39 
 
 
228 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6100  protein of unknown function DUF1045  43.09 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2937  hypothetical protein  41.23 
 
 
230 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1582  hypothetical protein  41.23 
 
 
230 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3153  protein of unknown function DUF1045  33.48 
 
 
235 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2177  hypothetical protein  40 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.132339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3771  phosphonate metabolism protein  37.83 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2956  hypothetical protein  41.62 
 
 
255 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0864549  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4200  phosphonate metabolism protein  41.84 
 
 
227 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.092802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0147  hypothetical protein  37.99 
 
 
231 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0493  protein of unknown function DUF1045  39.29 
 
 
262 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2854  hypothetical protein  42 
 
 
158 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0506  protein of unknown function DUF1045  38.78 
 
 
262 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3356  hypothetical protein  34.2 
 
 
235 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4775  hypothetical protein  38.86 
 
 
226 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112869  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0538  protein of unknown function DUF1045  34.05 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3358  hypothetical protein  41.85 
 
 
265 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.727632  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4488  hypothetical protein  33.04 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.738838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5938  phosphonate metabolism protein  37.93 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2285  hypothetical protein  32.62 
 
 
225 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.771755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2398  hypothetical protein  41.41 
 
 
271 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1932  phosphonate metabolism protein  32.62 
 
 
225 aa  92  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.128477  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2584  hypothetical protein  41.41 
 
 
271 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3348  hypothetical protein  41.41 
 
 
265 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.597836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1175  hypothetical protein  41.41 
 
 
271 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0314  hypothetical protein  41.41 
 
 
271 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3314  hypothetical protein  40.71 
 
 
259 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4183  hypothetical protein  35.56 
 
 
239 aa  88.2  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0769  hypothetical protein  36.09 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2922  phosphonate metabolism protein  40 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2918  hypothetical protein  34.36 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>