More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3668 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  100 
 
 		 330 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  68.31 
 
 		 329 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  66.26 
 
 		 329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  66.88 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  68.93 
 
 		 329 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  46.67 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  44.93 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  45.27 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  45.1 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  48.01 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  44.76 
 
 		 316 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  44.76 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  43.33 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  46.08 
 
 		 315 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  44.15 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  47.08 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  45.14 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  45.89 
 
 		 310 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  46.39 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  41 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  43.71 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  46.39 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  46.39 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  46.39 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  45.99 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  44.15 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  44.82 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  44.37 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  41.56 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  45.45 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  45.45 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  44.04 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  45.36 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  45.58 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  44.33 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  41.36 
 
 		 323 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  41.37 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  38.98 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  41.67 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  39.8 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  41.1 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  39.04 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  40.75 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  43.35 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  44.33 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  44.41 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  38.78 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  43.51 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  43.56 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  41.64 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  42.57 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  43.81 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  39.24 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  43.62 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  39.24 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  39.24 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  38.59 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  38.54 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  40.98 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  43.29 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  39.38 
 
 		 314 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  44.37 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  45.48 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  44.33 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  44.18 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  44.18 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  44.33 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  44.33 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  43.84 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  44.33 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  42.71 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  44.18 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  42.43 
 
 		 321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  42.11 
 
 		 321 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  37.46 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  42.16 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  41.36 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  41.96 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  34.55 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  42.47 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  40 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  37.76 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  41.1 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  41.1 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  41.84 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  41.1 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  38.87 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  38.87 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  42.14 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  41.64 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  34.65 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  34.24 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  33.11 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  34.52 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  33.79 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  34.34 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  40.14 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  38.96 
 
 		 316 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  38.33 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  33.56 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>