296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0419 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  100 
 
 		 313 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  95.21 
 
 		 313 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  92.97 
 
 		 313 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  86.54 
 
 		 313 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  84.35 
 
 		 313 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  84.94 
 
 		 313 aa  547  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  83.71 
 
 		 317 aa  535  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  73.31 
 
 		 318 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  71.25 
 
 		 315 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  70.74 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  70.29 
 
 		 314 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  70.61 
 
 		 317 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  69.58 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  68.37 
 
 		 320 aa  454  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  69.58 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  67.09 
 
 		 340 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  63.34 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  62.9 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  63.11 
 
 		 315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  62.46 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  58.65 
 
 		 316 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  59.62 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  58.97 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  58.97 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  57.56 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  57.83 
 
 		 315 aa  363  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  58.52 
 
 		 318 aa  361  8e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2081  glutathione synthetase  54.78 
 
 		 315 aa  361  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  56.73 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  55.63 
 
 		 317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  54.69 
 
 		 314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  54.17 
 
 		 314 aa  351  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  54.49 
 
 		 316 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  54.66 
 
 		 316 aa  348  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  53.4 
 
 		 311 aa  345  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  55.1 
 
 		 317 aa  345  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  53.21 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0261  glutathione synthetase  52.87 
 
 		 317 aa  339  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  52.4 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  51.24 
 
 		 334 aa  311  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  48.4 
 
 		 316 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 312 aa  275  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 312 aa  275  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  42.81 
 
 		 318 aa  256  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  47.35 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  40.84 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  44.52 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  41.8 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  43.93 
 
 		 322 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  43.45 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  42.21 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  41.48 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  41.03 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  43.22 
 
 		 323 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  41.03 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  41.03 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  40.51 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  40.19 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  41.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  41.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  41.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  41.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  41.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  41.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  41.88 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  41.59 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  41.59 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  39.3 
 
 		 309 aa  239  5.999999999999999e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  39.87 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  41.85 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  40.71 
 
 		 317 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  39.94 
 
 		 317 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  39.23 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  41.21 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  39.62 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  40.25 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  38.98 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  42.44 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  39.35 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  40.13 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  42.39 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  40.97 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  40.97 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  39.16 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>