54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3032 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  100 
 
 		 159 aa  314  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  90.57 
 
 		 159 aa  267  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  64.33 
 
 		 176 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  60.26 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  61.49 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  62.16 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  59.46 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  58.78 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  64.89 
 
 		 198 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  61.31 
 
 		 180 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  66.4 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  61.7 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50.66 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  48.77 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  50.34 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  58.02 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  49.68 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  50.31 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  56.8 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  54.62 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  54.62 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  53.08 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  54.62 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  53.62 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  51.47 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  47.73 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  34.03 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  37.78 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  29.32 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.67 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.43 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  26.95 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  29.73 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.73 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  34.95 
 
 		 193 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  25.71 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  28.47 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  27.91 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1154  water stress/hypersensitive response protein  27.68 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4298  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  26.79 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.541122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1115  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.17 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1139  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  24.44 
 
 		 158 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0667  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  24.5 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>