52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3555 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  314  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  59.4 
 
 		 198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  57.78 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  57.78 
 
 		 180 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  57.78 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  57.78 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  57.78 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  57.78 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  57.78 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  49.31 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  47.62 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  48.59 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  48.32 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  48.61 
 
 		 166 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  51.7 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  48.98 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  47.33 
 
 		 167 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  48.98 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  48.92 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  51.47 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  52.55 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  53.85 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  46.94 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  49.32 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  50.36 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  50.36 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50.36 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  49.25 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  50.37 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  49.28 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  48.15 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  51.15 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  52.63 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.08 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  31.06 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  31.5 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  30.71 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.73 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  39.39 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.99 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  26.85 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  30.43 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  25.44 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  31.48 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.57 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  26.57 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  31.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  26.4 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  28.28 
 
 		 280 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  20.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>