31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0097 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  851    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  47.92 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  44.5 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  37.14 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  36.8 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  34.71 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  31.02 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  33.12 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  29.69 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  30.04 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  27.37 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  29.17 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  31.52 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  32.16 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  28.53 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  23.01 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  25.97 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  31.44 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  27.32 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  26.97 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  31.18 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  25.76 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  27.93 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  28.07 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  29.05 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  23.75 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  24.06 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  22.05 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  29.61 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  27.71 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1796  hypothetical protein  26.38 
 
 		 359 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105142  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>