215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1342 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  100 
 
 		 378 aa  768    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  88.62 
 
 		 378 aa  665    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  58.44 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  46.93 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  47.73 
 
 		 388 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  47.73 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  47.73 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  46.03 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  48.95 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  48.95 
 
 		 381 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  47.38 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  48.34 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  47.01 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  47.4 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  49.09 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  46.88 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  47.57 
 
 		 380 aa  309  6.999999999999999e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  47.09 
 
 		 378 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  47.09 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  46.83 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  46.81 
 
 		 381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  48.95 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  48.14 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  46.4 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  46.4 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  46.68 
 
 		 379 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  46.68 
 
 		 379 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  46.68 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  46.68 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  48.4 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  45.53 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  45.53 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  45.26 
 
 		 380 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  47.17 
 
 		 379 aa  298  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  46.54 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  46.54 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  46.54 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  45.08 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  45.26 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  46.54 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  46.54 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  46.68 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  46.54 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  46.54 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  46.28 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  44.85 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  44.85 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  45 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  46.01 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  44.85 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  44.85 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  46.72 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  44.5 
 
 		 384 aa  293  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  46.38 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  45.38 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  45.38 
 
 		 380 aa  292  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  44.27 
 
 		 383 aa  292  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  51.08 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  47.73 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  46.44 
 
 		 380 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  45.26 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  45 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  45 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  45.91 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  45 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  44.74 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  45 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  45.89 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  45 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  45 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  44.85 
 
 		 381 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  41.01 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  43.73 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  51.08 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  43.2 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  50 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  43.55 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  42.93 
 
 		 381 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  44.32 
 
 		 377 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  44.68 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  42.93 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  42.93 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  41.71 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  42.93 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  44.8 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  42.47 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  48.47 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  41.71 
 
 		 373 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  50.46 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  48.46 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  43.8 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  42.63 
 
 		 383 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  44.32 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  48.47 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  47.85 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  44.44 
 
 		 381 aa  268  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  42.93 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  42.67 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  46.3 
 
 		 384 aa  265  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  42.74 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>