42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0056 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  100 
 
 		 301 aa  613  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  37.41 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  33.11 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  30.07 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  38.01 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  30.77 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  30.65 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.41 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  28.9 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.79 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.86 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  32.69 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  30.43 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  29.9 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  25.8 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.08 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.01 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  30.6 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  26.64 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  32.04 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.73 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  28.38 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.52 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  26.15 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  33.92 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  28.14 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  26.05 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  27.13 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.68 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  36.71 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0856  hypothetical protein  27.62 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  44.44 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  38.89 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.81 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  27.55 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  41.51 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.45 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  35.82 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  31.87 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  36.14 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  33.93 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  45.83 
 
 		 148 aa  42.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>