More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2312 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  67.57 
 
 
534 aa  779    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  63.67 
 
 
543 aa  704    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000185698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0450  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  61.93 
 
 
547 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  66.03 
 
 
536 aa  756    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0257  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  65.04 
 
 
542 aa  757    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  66.6 
 
 
536 aa  748    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  82.51 
 
 
549 aa  990    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0451  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  66.22 
 
 
549 aa  744    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.961487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  82.12 
 
 
549 aa  972    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1947  DsrK protein  85.97 
 
 
549 aa  1015    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  81.39 
 
 
549 aa  968    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  66.03 
 
 
536 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1606  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  70.66 
 
 
541 aa  802    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  100 
 
 
550 aa  1152    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  85.45 
 
 
549 aa  1004    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  66.99 
 
 
539 aa  763    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63071  normal  0.964876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  83.39 
 
 
549 aa  992    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  41.95 
 
 
496 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  43.89 
 
 
507 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  43.82 
 
 
500 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1958  hypothetical protein  40.51 
 
 
517 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  41.6 
 
 
515 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2191  hypothetical protein  36.9 
 
 
461 aa  286  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.2 
 
 
466 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  33.83 
 
 
446 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0076  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.62 
 
 
454 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1439  hypothetical protein  33.96 
 
 
492 aa  249  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174659 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0851  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.41 
 
 
493 aa  239  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  33.33 
 
 
490 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3198  hypothetical protein  32.43 
 
 
464 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  30.07 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.58 
 
 
471 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.91 
 
 
471 aa  188  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.11 
 
 
472 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.6 
 
 
457 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.48 
 
 
453 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  26.48 
 
 
453 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.46 
 
 
453 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.28 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.24 
 
 
533 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  26.81 
 
 
542 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  25.75 
 
 
439 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.86 
 
 
419 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  26.91 
 
 
444 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.5 
 
 
531 aa  143  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.1 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  25.81 
 
 
534 aa  140  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.86 
 
 
534 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.64 
 
 
438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  25.23 
 
 
420 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.62 
 
 
445 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.42 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  24.14 
 
 
439 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  26.7 
 
 
520 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  26.39 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.44 
 
 
505 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.4 
 
 
463 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0872  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.91 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.301742  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  24.69 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.99 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  24.89 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0573  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.37 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2410  hypothetical protein  25.42 
 
 
461 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.688183  normal  0.0784806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0845  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.76 
 
 
462 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  23.86 
 
 
418 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2255  hypothetical protein  24.54 
 
 
460 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
431 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0648  hmc operon protein 6  24.66 
 
 
462 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0594  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.75 
 
 
446 aa  104  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.44 
 
 
416 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.55 
 
 
431 aa  100  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1023  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.53 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  24.24 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1299  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.99 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1577  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.4 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26 
 
 
694 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  22.86 
 
 
409 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.09 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0947  Fe-S oxidoreductase-like protein  20.94 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.118909  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  22.54 
 
 
752 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.08 
 
 
722 aa  65.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.93 
 
 
723 aa  63.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  23.65 
 
 
727 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  21.6 
 
 
661 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  22.05 
 
 
730 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3960  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  26.48 
 
 
314 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.77 
 
 
658 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  22.34 
 
 
727 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.38 
 
 
699 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.48 
 
 
629 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  23.61 
 
 
683 aa  62  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.22 
 
 
658 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.78 
 
 
694 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.82 
 
 
698 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  24.26 
 
 
308 aa  60.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.61 
 
 
774 aa  60.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  23.23 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.02 
 
 
661 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>