More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0302 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  929    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.47 
 
 
451 aa  650    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  67.74 
 
 
438 aa  653    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  61.31 
 
 
439 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  60.88 
 
 
439 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.93 
 
 
445 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0573  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.41 
 
 
460 aa  300  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.67 
 
 
463 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0872  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.41 
 
 
461 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.301742  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2410  hypothetical protein  37.1 
 
 
461 aa  289  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.688183  normal  0.0784806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0648  hmc operon protein 6  36.12 
 
 
462 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2255  hypothetical protein  36.43 
 
 
460 aa  282  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0845  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.94 
 
 
462 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  32.33 
 
 
423 aa  209  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  31.13 
 
 
412 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.36 
 
 
416 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.51 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  32.16 
 
 
418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0076  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.54 
 
 
454 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2191  hypothetical protein  28.74 
 
 
461 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.71 
 
 
402 aa  192  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  28.89 
 
 
459 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.63 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.32 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  27.32 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  28.88 
 
 
420 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  28.61 
 
 
542 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3198  hypothetical protein  26.76 
 
 
464 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.08 
 
 
534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.74 
 
 
531 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  28.84 
 
 
534 aa  166  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  28.93 
 
 
549 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.47 
 
 
537 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  27.98 
 
 
549 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1947  DsrK protein  27.15 
 
 
549 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.53 
 
 
539 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63071  normal  0.964876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  28.02 
 
 
549 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  27.65 
 
 
549 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.12 
 
 
533 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.93 
 
 
457 aa  156  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0257  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.94 
 
 
542 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0851  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.81 
 
 
493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  26.91 
 
 
550 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  27.08 
 
 
549 aa  153  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1606  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.32 
 
 
541 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.16 
 
 
534 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0451  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.06 
 
 
549 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.961487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  27.51 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.88 
 
 
505 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  27.15 
 
 
515 aa  146  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  27.98 
 
 
520 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.64 
 
 
536 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  28.26 
 
 
536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1958  hypothetical protein  26.47 
 
 
517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.89 
 
 
536 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0450  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.72 
 
 
547 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.86 
 
 
543 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000185698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.96 
 
 
496 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.93 
 
 
471 aa  138  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.98 
 
 
439 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.5 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.35 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  26.62 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.67 
 
 
471 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.7 
 
 
472 aa  127  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  27.68 
 
 
432 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1023  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.74 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  25.37 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  27.92 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0594  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.56 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  24.12 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1439  hypothetical protein  24.58 
 
 
492 aa  106  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174659 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  23.22 
 
 
490 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.63 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.31 
 
 
383 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  27.86 
 
 
415 aa  97.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.36 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.21 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.49 
 
 
431 aa  94  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0459  hmc operon protein 6  39.42 
 
 
127 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3960  hypothetical protein  35.4 
 
 
169 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.75 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  25.61 
 
 
688 aa  87.4  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.25 
 
 
419 aa  87  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  23.47 
 
 
375 aa  86.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.54 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  23.19 
 
 
615 aa  84  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  22.22 
 
 
720 aa  84  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1577  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.56 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  24.58 
 
 
752 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.25 
 
 
629 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  24.43 
 
 
654 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.04 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.68 
 
 
713 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  22.75 
 
 
727 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  22.73 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3532  hypothetical protein  34.01 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  22.91 
 
 
730 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  24.56 
 
 
639 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  23.48 
 
 
692 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>