284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2555 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  66.36 
 
 
438 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
445 aa  929    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.28 
 
 
451 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  79.18 
 
 
439 aa  763    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  83.07 
 
 
439 aa  793    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  57.93 
 
 
444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2255  hypothetical protein  37.06 
 
 
460 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.96 
 
 
463 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2410  hypothetical protein  36.46 
 
 
461 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.688183  normal  0.0784806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0648  hmc operon protein 6  36.96 
 
 
462 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0872  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.49 
 
 
461 aa  253  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.301742  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0573  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.39 
 
 
460 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0845  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.58 
 
 
462 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  33.57 
 
 
412 aa  207  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.75 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  31.02 
 
 
459 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  31.83 
 
 
418 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  31.27 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.67 
 
 
534 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.13 
 
 
402 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  28.44 
 
 
534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0076  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.28 
 
 
454 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.58 
 
 
466 aa  169  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3198  hypothetical protein  30.39 
 
 
464 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.16 
 
 
537 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.44 
 
 
531 aa  166  9e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.92 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.59 
 
 
453 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  27.59 
 
 
453 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  27.25 
 
 
542 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2191  hypothetical protein  27.65 
 
 
461 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  29.37 
 
 
446 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.84 
 
 
533 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.11 
 
 
534 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.87 
 
 
457 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0851  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.73 
 
 
493 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  29.02 
 
 
536 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  26.42 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  26.2 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  26.58 
 
 
549 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  25.62 
 
 
550 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.32 
 
 
496 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1947  DsrK protein  25.45 
 
 
549 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.89 
 
 
539 aa  136  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63071  normal  0.964876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  28.38 
 
 
549 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  25.68 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  25.97 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.35 
 
 
439 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1958  hypothetical protein  27.46 
 
 
517 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  26.49 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.98 
 
 
536 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0450  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.89 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  25.17 
 
 
549 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1606  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.49 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  26.64 
 
 
515 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  26.94 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.98 
 
 
507 aa  127  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0451  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.74 
 
 
549 aa  126  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.961487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.95 
 
 
543 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000185698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.87 
 
 
505 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0257  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.37 
 
 
542 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  30.14 
 
 
515 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1023  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.38 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  27.2 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  26.9 
 
 
441 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.35 
 
 
451 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0594  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.58 
 
 
446 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.6 
 
 
471 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.55 
 
 
471 aa  104  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.04 
 
 
419 aa  104  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.96 
 
 
431 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.54 
 
 
431 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.84 
 
 
472 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  23.95 
 
 
409 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.68 
 
 
713 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  24.88 
 
 
720 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  23.83 
 
 
490 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.23 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.79 
 
 
392 aa  87  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  25.56 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.76 
 
 
629 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  23.47 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1439  hypothetical protein  22.42 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.37 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  24.21 
 
 
663 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.67 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  24.29 
 
 
727 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1577  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.94 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  23.84 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2437  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  24.38 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.94 
 
 
385 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  25.72 
 
 
692 aa  77  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0459  hmc operon protein 6  36.54 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  23.4 
 
 
752 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  25.13 
 
 
688 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1299  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.89 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  24.77 
 
 
730 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.88 
 
 
722 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2479  hypothetical protein  23.36 
 
 
631 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  22.99 
 
 
683 aa  73.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>