More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1642 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
323 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  91.64 
 
 
323 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  90.4 
 
 
327 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  87.93 
 
 
327 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.24 
 
 
323 aa  579  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  89.31 
 
 
317 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.52 
 
 
331 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.69 
 
 
316 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.1 
 
 
316 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.1 
 
 
316 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
316 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 
322 aa  362  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
325 aa  358  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
313 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
314 aa  351  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.47 
 
 
319 aa  350  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  57.83 
 
 
327 aa  349  4e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
316 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
319 aa  348  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
318 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
318 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
309 aa  348  8e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.05 
 
 
309 aa  345  4e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.86 
 
 
309 aa  345  5e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
319 aa  345  6e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  345  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 
317 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
321 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 
316 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
338 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.58 
 
 
309 aa  344  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
314 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
318 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
330 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
317 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
320 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
309 aa  342  7e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
315 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
321 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
315 aa  341  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
315 aa  341  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
315 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 
325 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
321 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.7 
 
 
309 aa  341  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
321 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.75 
 
 
314 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
309 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
320 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
320 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  55.34 
 
 
312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  53.23 
 
 
313 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.37 
 
 
311 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
318 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
313 aa  338  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.68 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
314 aa  335  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
315 aa  335  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
323 aa  335  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
314 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.27 
 
 
313 aa  334  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.92 
 
 
310 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
359 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.92 
 
 
313 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  51.92 
 
 
321 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
324 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
314 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.92 
 
 
313 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.92 
 
 
313 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>