39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0369 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  88.19 
 
 
237 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  83.97 
 
 
237 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  70.46 
 
 
237 aa  362  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  71.73 
 
 
227 aa  348  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  33.87 
 
 
719 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  30.06 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  28.82 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  28.22 
 
 
286 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  27.23 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  30.27 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  36.13 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  32.88 
 
 
387 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  25.12 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  31.73 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  24.65 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  29.17 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  29.73 
 
 
1011 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  28.29 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  24.73 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58284  dolichol kinase  31.79 
 
 
562 aa  53.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0456879  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  29.1 
 
 
208 aa  52.4  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  25.45 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  28.21 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  25.77 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  27.14 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  26.5 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  27.27 
 
 
211 aa  48.5  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  33.98 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  21.74 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  31.2 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  27.18 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  26.26 
 
 
444 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  31.13 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32849  predicted protein  39.13 
 
 
419 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  35.29 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  32.5 
 
 
204 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>