40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0051 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  100 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  72.62 
 
 		 84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  70.24 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  70.24 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  67.86 
 
 		 84 aa  116  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  64.29 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  51.19 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  41.67 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  34.52 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  37.21 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  35.71 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  33.73 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  34.52 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  34.18 
 
 		 254 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.88 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  32.14 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  32.14 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  36.84 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  31.4 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  33.33 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  32.56 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  35.53 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  29.76 
 
 		 74 aa  43.9  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  32.14 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  34.21 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  34.21 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  32.89 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0174  MoaD family protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.704451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  34.21 
 
 		 251 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  32.14 
 
 		 75 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  34.69 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  29.76 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  28.28 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  31.17 
 
 		 251 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  31.17 
 
 		 251 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  31.17 
 
 		 251 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  34.57 
 
 		 251 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>