53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1362 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  100 
 
 
158 aa  324  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  60.65 
 
 
158 aa  208  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  53.8 
 
 
158 aa  184  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  53.8 
 
 
158 aa  184  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  51.9 
 
 
164 aa  181  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.07 
 
 
167 aa  127  7e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  36.88 
 
 
175 aa  117  5e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  38.12 
 
 
168 aa  117  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  36.13 
 
 
168 aa  114  7e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  33.94 
 
 
168 aa  103  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  37.82 
 
 
171 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  31.48 
 
 
173 aa  101  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  37.75 
 
 
171 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  35.9 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  37.14 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  36.97 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  35.53 
 
 
171 aa  94.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  32.92 
 
 
165 aa  93.6  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  36.75 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 
167 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  30.86 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.88 
 
 
162 aa  79.3  2e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 
166 aa  77.8  6e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.57 
 
 
184 aa  75.5  3e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.31 
 
 
178 aa  74.3  6e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.36 
 
 
163 aa  72.4  2e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  30.95 
 
 
183 aa  72.4  3e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  8.44745e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  35.42 
 
 
180 aa  68.2  4e-11  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  27.85 
 
 
176 aa  65.5  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  28.31 
 
 
162 aa  65.1  4e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  31.47 
 
 
174 aa  64.7  4e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.95 
 
 
171 aa  62  3e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 
169 aa  58.2  4e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  26.39 
 
 
173 aa  52.4  2e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.49 
 
 
163 aa  50.8  6e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.19 
 
 
162 aa  50.1  1e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.54 
 
 
159 aa  48.9  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.12 
 
 
178 aa  48.5  3e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.18 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.1 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  32.93 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  26.81 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.08 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.08 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.08 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  23.35 
 
 
168 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.91487e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.21 
 
 
179 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.07557e-06  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  25.83 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.38 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  7.39352e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  29.32 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.67 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  32.46 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  40.8  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>