More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2450 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  88.85 
 
 		 305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  88.85 
 
 		 305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  84.26 
 
 		 305 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  83.93 
 
 		 305 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  66.67 
 
 		 303 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  60.85 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  63.37 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  58.84 
 
 		 303 aa  358  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.98 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  61.57 
 
 		 302 aa  350  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  58.09 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.8 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  61.48 
 
 		 315 aa  349  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  58.62 
 
 		 303 aa  348  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  58.28 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  62.71 
 
 		 305 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  60.94 
 
 		 303 aa  348  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  57.79 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  59.58 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  60.14 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  58.33 
 
 		 303 aa  345  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  57.91 
 
 		 306 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  59.23 
 
 		 303 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  63.47 
 
 		 303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  56.4 
 
 		 303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  63.1 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  63.47 
 
 		 313 aa  342  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  62.73 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  56.95 
 
 		 306 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  58.27 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  61.25 
 
 		 303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  61.25 
 
 		 303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  64.19 
 
 		 315 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  56.44 
 
 		 306 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  58.42 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  62.54 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.89 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  54.43 
 
 		 315 aa  335  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  58.09 
 
 		 317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  57.76 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.95 
 
 		 317 aa  335  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  65.05 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.08 
 
 		 323 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.08 
 
 		 323 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  57.62 
 
 		 306 aa  331  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.62 
 
 		 306 aa  331  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  64.63 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  60 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  54.61 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.18 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  51.83 
 
 		 310 aa  320  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  57.14 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  56.44 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  58.52 
 
 		 304 aa  318  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  59 
 
 		 312 aa  318  7e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  58.15 
 
 		 304 aa  318  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.74 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  53.77 
 
 		 335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  53.11 
 
 		 335 aa  309  5e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  52.65 
 
 		 350 aa  308  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  61.07 
 
 		 317 aa  308  9e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.78 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.71 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.01 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  57.5 
 
 		 349 aa  295  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  56.23 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  48.81 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.33 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48.36 
 
 		 310 aa  288  9e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.84 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.08 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.12 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.36 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.36 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  50.88 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  50.53 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.13 
 
 		 310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  48.19 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  52.49 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  48.19 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.84 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.47 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.35 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.4 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.01 
 
 		 316 aa  279  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  52.07 
 
 		 314 aa  279  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  50.37 
 
 		 347 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  43.27 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  50.37 
 
 		 331 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  48.93 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.07 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  44.57 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 		 354 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  42.19 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.03 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  49.62 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.53 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  50.37 
 
 		 319 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>