70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0737 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  327  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63350  GNAT family acetyltransferase  68.79 
 
 
160 aa  233  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0386363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5516  hypothetical protein  67.52 
 
 
160 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0870  GCN5-related N-acetyltransferase  53.55 
 
 
159 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  53.5 
 
 
159 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0830  acetyltransferase  52.23 
 
 
159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00814406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  49.34 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  49.34 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  47.77 
 
 
158 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3570  acetyltransferase, GNAT family  42.76 
 
 
197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
165 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4210  hypothetical protein  30.3 
 
 
233 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2511  hypothetical protein  35.37 
 
 
330 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.85 
 
 
150 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1491  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51524  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3436  hypothetical protein  28.89 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.160224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  31.88 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  31.88 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3079  hypothetical protein  31.4 
 
 
227 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  30.14 
 
 
365 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2994  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32833  predicted protein  36.07 
 
 
376 aa  44.7  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.742524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  30.14 
 
 
365 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0026  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00586095  normal  0.766607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.58 
 
 
371 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1382  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
294 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  30.23 
 
 
363 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360352  normal  0.789976 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03825  GNAT family acetyltransferase Nat4, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08210)  32.18 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4427  hypothetical protein  30.68 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.328932  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1502  putative acyltransferase  22.86 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0860321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
285 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6557  hypothetical protein  32.93 
 
 
274 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0139497  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
381 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0538  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0032  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
160 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  27.21 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  26.76 
 
 
285 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
146 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3156  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
161 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
152 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.4 
 
 
181 aa  41.2  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3613  hypothetical protein  29.58 
 
 
197 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.265269  hitchhiker  0.000230131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
399 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
414 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01975  acetyltransferase  25.47 
 
 
217 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0699749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.9 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
400 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
141 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
414 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
414 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1853  acetyltransferase  40.35 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0961913  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0401  acetyltransferase  40.35 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2121  acetyltransferase  40.35 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1146  acetyltransferase  40.35 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0857  acetyltransferase  40.35 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1754  acetyltransferase  40.35 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1517  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0312  acetyltransferase  40.35 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>