130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0350 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  100 
 
 		 454 aa  896    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  72.25 
 
 		 454 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5421  adenylate cyclase  71.43 
 
 		 456 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274372  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68810  hypothetical protein  72.25 
 
 		 454 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  70.04 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0252  adenylate cyclase  70.7 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04860  Adenylate cyclase domain-containing protein  72.03 
 
 		 454 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5247  adenylate cyclase  67.62 
 
 		 455 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5187  adenylate cyclase  68.06 
 
 		 455 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5094  adenylate cyclase  68.06 
 
 		 455 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0276  adenylate cyclase  67.4 
 
 		 458 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  30.15 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  30.48 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  30.48 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  30.48 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  30.48 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  30.48 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  30.48 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  30.73 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  30.23 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  29.8 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  29.8 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  29.8 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  29.8 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  29.8 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  40.77 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  33.57 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  34.77 
 
 		 505 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  40.17 
 
 		 511 aa  126  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  39.92 
 
 		 286 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  30.42 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  29.78 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  29.45 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  35.54 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  29.77 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  29.77 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  29.77 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  40 
 
 		 508 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  38.81 
 
 		 499 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  37.92 
 
 		 512 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  41.23 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  41.23 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  41.23 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  41.23 
 
 		 213 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  41.23 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  31.82 
 
 		 505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  38.32 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  37.92 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  29.62 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  31.03 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  43.37 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  46.93 
 
 		 207 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  43.37 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  35.83 
 
 		 512 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  37.41 
 
 		 509 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  41.71 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  33.74 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  40.28 
 
 		 215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  40.28 
 
 		 215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  36.27 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  39.23 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  39.29 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  39.29 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  35.78 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  42.13 
 
 		 211 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  30 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  38.69 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  28.31 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  38.69 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  35.8 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  36 
 
 		 495 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  38.02 
 
 		 503 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  40.68 
 
 		 512 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  40.68 
 
 		 512 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  36.84 
 
 		 508 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  42.53 
 
 		 208 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  39.22 
 
 		 500 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  42.53 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  42.53 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  28.32 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  36.76 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  40.76 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  38.43 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  37.44 
 
 		 219 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  34.89 
 
 		 596 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  35.68 
 
 		 503 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  39.35 
 
 		 321 aa  99.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  43.06 
 
 		 206 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  36.06 
 
 		 347 aa  99.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  34.55 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  35.54 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  37.26 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  39.13 
 
 		 208 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  37.89 
 
 		 492 aa  97.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  36.87 
 
 		 219 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  31.58 
 
 		 502 aa  96.7  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 543 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  30.14 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>