295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0360 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0360  phosphocarrier, HPr family  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237726  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  44.93 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  38.27 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2016  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.95 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2283  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.71 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  37.8 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  39.02 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  37.8 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  32.93 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2151  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.42 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2878  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0254  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.97 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2443  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.71 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.51 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0167  HPrNtr  37.66 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  33.75 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3314  phosphocarrier, HPr family  36.59 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  34.62 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  37.66 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.67 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.75 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1090  HPrNtr  41.33 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.75 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  34.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  32.93 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14490  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.33 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00608366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1236  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.04 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.996833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.75 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  37.8 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  36.59 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  37.8 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  34.15 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1735  HPrNtr domain-containing protein  39.51 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2307  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.18 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0458616  normal  0.112243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.18 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.5 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1738  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.14 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  32.47 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.59 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2076  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.65 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.53 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  35.37 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  33.33 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  35.14 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  32.47 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  40.54 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0323  phosphocarrier, HPr family  34.62 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  31.65 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07040  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  40.7 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.75 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  31.17 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0716  phosphocarrier protein HPr  33.8 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  33.75 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.75 
 
 
94 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1795  phosphocarrier, HPr family  40.85 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  34.18 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  29.63 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  37.68 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  37.68 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  32.5 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  34.15 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0669  phosphocarrier protein HPr  27.16 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.829245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  29.87 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.18 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  29.87 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0145  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.16 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000262907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5271  phosphocarrier protein Chr  33.33 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  27.16 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3695  phosphocarrier protein Chr  31.65 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.23 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2961  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.53 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4945  phosphocarrier protein Chr  33.33 
 
 
82 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01690  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.14 
 
 
93 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1549  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.27 
 
 
86 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000108973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  32.05 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4112  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.71 
 
 
657 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0882  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.71 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000535519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.76 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  34.62 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2230  HPrNtr  32.91 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.25 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>