More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1236 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1236  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
89 aa  177  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.996833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0254  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.18 
 
 
88 aa  124  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2283  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.97 
 
 
88 aa  123  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2307  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
88 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0458616  normal  0.112243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2076  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  66.67 
 
 
88 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2443  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  66.67 
 
 
103 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0167  HPrNtr  65.52 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  62.5 
 
 
88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  46.43 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.62 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  45.24 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.24 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  47.13 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  50.56 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  48.28 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1912  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.51 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 
88 aa  84.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1923  HPr family phosphocarrier protein  48.19 
 
 
86 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1641  phosphocarrier protein (Hpr)  48.19 
 
 
86 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.13 
 
 
89 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  43.68 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2967  phosphocarrier protein Chr  49.35 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000334349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  43.53 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  46.99 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  45.98 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  44.83 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.53 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  42.7 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  46.99 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3695  phosphocarrier protein Chr  46.43 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  46.07 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  46.07 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  46.07 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  43.82 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4945  phosphocarrier protein Chr  45.12 
 
 
82 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01690  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.35 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4094  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.44 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0707453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5271  phosphocarrier protein Chr  43.9 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.05 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1738  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.37 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.45 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0323  phosphocarrier, HPr family  43.75 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.23 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  42.7 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0980  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  40.23 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  41.86 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.7 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0773  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.37 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106388  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  41.38 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  41.38 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.33 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  39.08 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  41.57 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.57 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0360  phosphocarrier, HPr family  43.04 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.237726  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0669  phosphocarrier protein HPr  40 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.829245  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  39.33 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4116  phosphocarrier protein HPr  44.05 
 
 
87 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.67 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  39.08 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.08 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  39.33 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  39.08 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4180  phosphocarrier protein HPr  44.05 
 
 
87 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.08 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  39.08 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  44.05 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.57 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.37 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  37.65 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  39.08 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  39.33 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1735  HPrNtr domain-containing protein  48.72 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  45.07 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  45.07 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.38 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2748  phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  41.18 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.45 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  37.93 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2132  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.57 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>