More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3344 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
274 aa  561  1e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
287 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
290 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
294 aa  145  7e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
327 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 
294 aa  135  6e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  41.23 
 
 
327 aa  135  6e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
324 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
340 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
294 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
312 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
312 aa  114  1e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
308 aa  113  4e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
329 aa  111  1e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
308 aa  111  1e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
703 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
326 aa  108  9e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
360 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
314 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
307 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
303 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
401 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
305 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
345 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.05364e-06 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
324 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
289 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
307 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
311 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
327 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
691 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
324 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  33.18 
 
 
338 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
824 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
340 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
308 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
313 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
304 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
305 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.47 
 
 
652 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
683 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
1152 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  2.47035e-05 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
296 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
296 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
296 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  30.74 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 
836 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.91 
 
 
379 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
691 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
691 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
415 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
361 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
378 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
1077 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
324 aa  95.5  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
1340 aa  95.5  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  31.3 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  31.36 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
336 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.65 
 
 
336 aa  93.6  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
841 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  30.91 
 
 
339 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.89 
 
 
311 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
1739 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
350 aa  92.8  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
306 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
892 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
310 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
336 aa  92  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
994 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
1162 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
995 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
387 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
305 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
317 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  31.82 
 
 
860 aa  89.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.71 
 
 
301 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
430 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  35.65 
 
 
838 aa  88.6  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  27.06 
 
 
330 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>