185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0771 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
95 aa  197  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  71.58 
 
 
101 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  71.58 
 
 
107 aa  147  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60.87 
 
 
100 aa  125  2e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  59.78 
 
 
110 aa  124  4e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  56.38 
 
 
95 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  55.32 
 
 
95 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  56.52 
 
 
97 aa  119  1e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.95 
 
 
95 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.76 
 
 
95 aa  117  8e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  58.43 
 
 
120 aa  114  4e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  59.78 
 
 
95 aa  113  7e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  57.89 
 
 
95 aa  113  8e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  58.82 
 
 
95 aa  112  2e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  57.47 
 
 
98 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  54.44 
 
 
110 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.19 
 
 
95 aa  110  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  55.06 
 
 
95 aa  109  1e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  55.56 
 
 
109 aa  109  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  56.98 
 
 
96 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  56.98 
 
 
96 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  59.3 
 
 
96 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 
102 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.69 
 
 
96 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  53.85 
 
 
95 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  52.13 
 
 
95 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 
100 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.61 
 
 
96 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 
111 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  55.81 
 
 
96 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 
102 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  50.53 
 
 
95 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
99 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  53.93 
 
 
95 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  48.31 
 
 
113 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  51.09 
 
 
101 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 
115 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 
114 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 
118 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  48.91 
 
 
130 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 
104 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  48.35 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  46.51 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  49.46 
 
 
98 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  52.87 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  46.74 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.07 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  44.94 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 
95 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  48.24 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  48.35 
 
 
95 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  51.76 
 
 
113 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  49.41 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  44.09 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  44.32 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  44.94 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.02 
 
 
99 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  45.88 
 
 
95 aa  82.4  2e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.33 
 
 
96 aa  77  8e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 
98 aa  75.9  2e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  42.53 
 
 
101 aa  72.4  2e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  58.33 
 
 
79 aa  72  3e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  71.2  5e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 
141 aa  64.3  5e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 
88 aa  62.8  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  30.85 
 
 
116 aa  59.7  1e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  38.64 
 
 
107 aa  59.7  1e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.75 
 
 
88 aa  58.2  4e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.59134e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  38.46 
 
 
83 aa  56.6  1e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 
108 aa  56.6  1e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 
82 aa  55.8  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 
82 aa  55.8  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.89 
 
 
90 aa  55.8  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  41.38 
 
 
67 aa  56.2  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  36.25 
 
 
82 aa  54.7  4e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  35.16 
 
 
96 aa  53.9  7e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 
103 aa  53.9  7e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.74 
 
 
104 aa  53.9  8e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.35 
 
 
91 aa  53.5  9e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 
79 aa  53.5  9e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  37.35 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  35.87 
 
 
104 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  41.46 
 
 
106 aa  53.1  1e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.12 
 
 
86 aa  52.8  2e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>