More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1504 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  100 
 
 
153 aa  322  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  53.64 
 
 
149 aa  155  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  50 
 
 
150 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  51.33 
 
 
149 aa  154  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  51.32 
 
 
158 aa  154  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  48.37 
 
 
149 aa  154  5e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  50.98 
 
 
148 aa  154  5e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  48.37 
 
 
149 aa  153  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.11 
 
 
154 aa  150  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.33 
 
 
149 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.33 
 
 
149 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  47.33 
 
 
149 aa  146  1e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  50 
 
 
151 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  48 
 
 
149 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  53.49 
 
 
126 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  44.14 
 
 
160 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.21 
 
 
159 aa  133  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.21 
 
 
159 aa  133  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  41.55 
 
 
162 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.74 
 
 
171 aa  129  1e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  47.18 
 
 
163 aa  124  4e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  47.18 
 
 
163 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  47.18 
 
 
163 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.36 
 
 
165 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  47.18 
 
 
163 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  47.18 
 
 
163 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  47.18 
 
 
163 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.86 
 
 
154 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  45.86 
 
 
154 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  42.96 
 
 
163 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.67 
 
 
153 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  47.18 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  43.42 
 
 
160 aa  122  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.96 
 
 
142 aa  120  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  42.14 
 
 
140 aa  119  1e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.44 
 
 
151 aa  116  1e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.48 
 
 
137 aa  116  1e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.68 
 
 
145 aa  115  2e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.37 
 
 
149 aa  113  8e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  39.86 
 
 
147 aa  112  1e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.03 
 
 
137 aa  112  1e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.3 
 
 
135 aa  109  1e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.23 
 
 
153 aa  109  2e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.46 
 
 
145 aa  108  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.86 
 
 
141 aa  107  4e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  45.86 
 
 
154 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  44.93 
 
 
143 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  38.85 
 
 
152 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 
143 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  39.73 
 
 
147 aa  105  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.2 
 
 
143 aa  104  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.53 
 
 
144 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.88 
 
 
148 aa  103  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.07 
 
 
139 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.46 
 
 
175 aa  101  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.25 
 
 
145 aa  101  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.57 
 
 
132 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.13 
 
 
132 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.01 
 
 
153 aa  101  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.25 
 
 
155 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.55 
 
 
150 aa  101  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.41 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.03 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.78 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.78 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  38.41 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  39.86 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  35.42 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.20118e-08  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  36.69 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  33.81 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.59 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.09 
 
 
154 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2053  NifU domain-containing protein  37.14 
 
 
144 aa  94  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.415003  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.43 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98269e-10 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.57 
 
 
130 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.03 
 
 
151 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.07 
 
 
151 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.51 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.39 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.14 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.78 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.08 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  32.35 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.35 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.35 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.03 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.51 
 
 
156 aa  90.5  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.03 
 
 
152 aa  90.5  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  34.56 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.71 
 
 
151 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  7.71916e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.11 
 
 
178 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  34.33 
 
 
172 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>