More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2612 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  68.55 
 
 
581 aa  705  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  62.14 
 
 
583 aa  664  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  100 
 
 
555 aa  1080  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  68.4 
 
 
572 aa  727  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  74.32 
 
 
577 aa  800  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  65.82 
 
 
587 aa  669  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  64.78 
 
 
575 aa  671  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  63.11 
 
 
581 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  58.63 
 
 
579 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  63.08 
 
 
580 aa  618  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  62.7 
 
 
583 aa  618  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  64.6 
 
 
573 aa  612  1e-174  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  63.31 
 
 
568 aa  604  1e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  62.87 
 
 
545 aa  603  1e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  58.88 
 
 
564 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  62.59 
 
 
544 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  63.51 
 
 
632 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  52.66 
 
 
550 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  60.73 
 
 
426 aa  453  1e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  46.54 
 
 
568 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  47.88 
 
 
581 aa  439  1e-122  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  46.54 
 
 
570 aa  439  1e-122  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  44.87 
 
 
572 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  45.22 
 
 
568 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  45.32 
 
 
570 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  44.42 
 
 
559 aa  419  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  44.06 
 
 
568 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  45.9 
 
 
568 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  44.97 
 
 
556 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  42.66 
 
 
552 aa  405  1e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  44.79 
 
 
553 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  3.64529e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  41.62 
 
 
551 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  42.64 
 
 
552 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  41.44 
 
 
551 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  45.04 
 
 
606 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2627  sulphate transporter  57.6 
 
 
385 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  41.07 
 
 
545 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  42.21 
 
 
552 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  39.35 
 
 
605 aa  387  1e-106  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  44.47 
 
 
553 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.18031e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  42.78 
 
 
558 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  41.28 
 
 
587 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  44.19 
 
 
567 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  41.64 
 
 
553 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  44.86 
 
 
552 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  43.07 
 
 
563 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  44 
 
 
567 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  45.89 
 
 
551 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  41.64 
 
 
552 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  41.85 
 
 
563 aa  364  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  44.15 
 
 
541 aa  362  9e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  40.47 
 
 
560 aa  359  6e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  43.68 
 
 
554 aa  358  1e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  40.81 
 
 
587 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  40.5 
 
 
573 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  46.14 
 
 
553 aa  343  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  41.07 
 
 
588 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2760  sulphate transporter  45.42 
 
 
607 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.207505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  39.88 
 
 
583 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  40.65 
 
 
590 aa  338  1e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  40.86 
 
 
590 aa  338  1e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  39.57 
 
 
585 aa  337  2e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  40.32 
 
 
590 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  40.46 
 
 
560 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  41.6 
 
 
587 aa  330  5e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  41.6 
 
 
587 aa  330  5e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  42.78 
 
 
586 aa  330  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  41.6 
 
 
587 aa  329  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  43.16 
 
 
559 aa  329  9e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  41.03 
 
 
587 aa  326  8e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  40.29 
 
 
556 aa  326  8e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  40.38 
 
 
558 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  43.17 
 
 
565 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  43.17 
 
 
565 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  36.88 
 
 
574 aa  322  9e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  42.97 
 
 
565 aa  321  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  42.46 
 
 
567 aa  320  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2268  putative sulfate transporter YchM  42.46 
 
 
572 aa  316  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  39.89 
 
 
575 aa  314  3e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  34.08 
 
 
563 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.13177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  41.55 
 
 
571 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1914  putative sulfate transporter YchM  40.35 
 
 
561 aa  309  1e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200297  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1978  putative sulfate transporter YchM  40.35 
 
 
561 aa  308  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846232  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1540  putative sulfate transporter YchM  40.16 
 
 
561 aa  308  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0985805  normal  0.161381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1356  putative sulfate transporter YchM  40.16 
 
 
561 aa  308  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0275368  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1920  putative sulfate transporter YchM  40.16 
 
 
561 aa  305  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0235525  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  39.02 
 
 
578 aa  303  4e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  41.22 
 
 
562 aa  303  5e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2342  putative sulfate transporter YchM  41.14 
 
 
560 aa  302  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  40.24 
 
 
579 aa  299  8e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  36.12 
 
 
550 aa  296  5e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2420  putative sulfate transporter YchM  38.26 
 
 
550 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643639  hitchhiker  0.00551985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1311  putative sulfate transporter YchM  38.26 
 
 
550 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.28855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01191  hypothetical protein  38.26 
 
 
559 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01181  predicted transporter  38.26 
 
 
559 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1353  putative sulfate transporter YchM  38.26 
 
 
550 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000101083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2441  sulfate transporter  38.26 
 
 
550 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1687  putative sulfate transporter YchM  38.26 
 
 
559 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000554758  normal  0.520634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1936  putative sulfate transporter YchM  38.26 
 
 
559 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.6191e-05  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  39.31 
 
 
565 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>