More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2264 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.22 
 
 
233 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  62.34 
 
 
235 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  60.17 
 
 
234 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  61.04 
 
 
235 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  59.13 
 
 
231 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.13 
 
 
231 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.14 
 
 
237 aa  295  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.19 
 
 
231 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.37 
 
 
255 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  59.57 
 
 
362 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.83 
 
 
231 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  58.37 
 
 
234 aa  291  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  59.74 
 
 
234 aa  291  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.37 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.94 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  59.74 
 
 
235 aa  289  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.94 
 
 
234 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  59.74 
 
 
235 aa  289  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  57.94 
 
 
234 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.94 
 
 
234 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.73 
 
 
232 aa  288  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  58.8 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.51 
 
 
234 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  57.58 
 
 
234 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.87 
 
 
234 aa  284  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.15 
 
 
234 aa  284  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  58.12 
 
 
234 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.37 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.61 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  58.19 
 
 
232 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  58.37 
 
 
234 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  58.77 
 
 
232 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.01 
 
 
234 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.47 
 
 
235 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  56.39 
 
 
233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.64 
 
 
231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  55.93 
 
 
244 aa  272  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  57.71 
 
 
231 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.21 
 
 
240 aa  271  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  53.45 
 
 
234 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  52.59 
 
 
236 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  56.14 
 
 
229 aa  262  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  53.45 
 
 
236 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  52.16 
 
 
234 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  52.36 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  50.86 
 
 
236 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  60.32 
 
 
205 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  51.12 
 
 
255 aa  218  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.63 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  50 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  51.4 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  52.8 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
230 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  50.23 
 
 
233 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
230 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  50 
 
 
230 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 
230 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.46 
 
 
231 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 
230 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
230 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.46 
 
 
233 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.45 
 
 
242 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  48.6 
 
 
230 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  48.37 
 
 
230 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  51.17 
 
 
236 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  48.4 
 
 
234 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  49.3 
 
 
230 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  50.7 
 
 
236 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  48.84 
 
 
230 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.83 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.36 
 
 
236 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  48.61 
 
 
229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.93 
 
 
241 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.6 
 
 
211 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  47.44 
 
 
239 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  47.42 
 
 
230 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.42 
 
 
263 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.12 
 
 
211 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  48.11 
 
 
204 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  47.12 
 
 
211 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  46.63 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  47.44 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  46.92 
 
 
228 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.11 
 
 
233 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  46.05 
 
 
237 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 
233 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  44.65 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  46.89 
 
 
208 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  43.13 
 
 
227 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  45.79 
 
 
239 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  44.39 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  46.67 
 
 
233 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.67 
 
 
222 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  46.67 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>